ISOLASI, AMPLIFIKASI DAN SEKUENSING FRAGMEN 1,9 KILOBASA GEN HEAT SHOCK PROTEIN 70 SALMONELLA ENTERICA SEROVAR TYPHI

Muktiningsih Muktiningsih, Fera Kurniadewi, Imanuelle Orchidea R P

Abstract

Salmonella enterica serovar Typhi merupakan penyebab demam tifoid atau penyakit tifus pada manusia. Mekanisme molekuler patogenesitas Salmonella merupakan sistem yang kompleks dan diatur oleh sejumlah gen dan faktor-faktor virulen. Salah satu gen tersebut adalah dnaK yang mengatur sintesis Heat Shock Protein 70 (HSP70). Penelitian ini bertujuan
untuk memperoleh gen HSP70 yang berukuran 1,9 kilobasa dari bakteri Salmonella enterica serovar Typhi. Gen tersebut dapat digunakan untuk pengembangan vaksin tifus maupun diteliti lebih lanjut untuk mengungkap fungsi lainnya. Gen HSP70 berhasil diamplifikasi dari genom S. Typhi dengan reaksi polimerisasi DNA (PCR) menggunakan pasangan primer spesifik HSP70. Hasil elektroforesis menunjukkan bahwa produk amplifikasi tersebut berukuran 1900 pasang basa.Produk PCR dimurnikan sebelum urutan nukleotidanya ditentukan melalui sekuensing. Analisis hasil sekuensing menunjukkan produk PCR tersebut memiliki homologi sebesar 99% dengan dnaK (gen HSP70) S.enterica serovar Typhi strain CT18 yang terdapat pada gene database NCBI.

Keywords

Salmonella enterica serovar Typhi; PCR; dnaK; HSP 70; sekuensing

Full Text:

PDF

References

Crump, John. A and Eric D. Mintz. 2010. Clinical Infectious Diseases 2010, 50, 241-6.

De Jong, HK, et.al. 2012.. PLoS Pathog 8(10): e1002933.

Deng, W., Liou, S. R., Plunkett, G. III, Mayhew, G. F., Rose, D. J., Burland, V., Kodoyianni, V., Schwartz, D. C.,

and Blattner, F. R. 2003. J. Bacteriol. 2003, 185(7), 2330-2337.

Downes, F. P. dan Ito K. 2001. Compendium of Methods for The Microbiological Examination of Foods, 4th Ed., APHA, Washingtion, D.C.

Fabrega, Anna dan Jordi Vila, 2013, Clinical Microbiology Reviews. Vol. 26 No. 2. p.308-341.

Grimont PAD, Weill FX., 2007, Antigenic formulae of the Salmonella serovars, 9th revision, World Health

Organization Collaborating Center for Reference and Research on

Salmonella, Pasteur Institute, Paris, Perancis.

Grimont PAD, Weill FX., 2007, Antigenic formulae of the Salmonella serovars, 9th revision, World Health

Organization Collaborating Center forReference and Research on

Salmonella, Pasteur Institute, Paris, Perancis.

Heymann, DL. Ed., 2008, Control of Communicable Diseases Manual (19thEdition). American Public Health

Association, 978-0-87553-189-2, Washington, D.C.

Kaufmann, S. H. E., 1990, Immunol. Today,11,129–136.

Lehman, Donald., 2013, Triple Sugar Iron Agar Protocols. ASM.

Leon, R. O., 2008, Bulletin of The World Health Organization. 86, 4, 241-320.

Majowicz, S. E., 2010, Clin.Infect Dis, 50, 882-889.

McNulty, S., 2013, Rev.Immunology, 139, 407-415.

McPherson, M.J. and Møller, S., 2006, PCR 2nd Edition. Taylor & Francis Group, New York

Paliwal, P.K., 2011, Vaccine, 29, 6532-6539.

Takaya, A., Tomoyasu, T., Matsui, H., Yamamoto, T., 2004, Infection and Immunity, 72, 3,1364-1373.

Takaya, A, Kubota, Y, Isogai, E, Yamamoto, T., 2005, Mol. Microbiol., 55, 839–852.

Takaya, A., Matsui M., Tomoyasu T., Mol. Microbiol., 59, 1327–1340.

Vogel, A. I. dan G. Svehla, 1996. Vogel’s Qualitative Inorganic Analysis 7th ed. Prentice Hall, Inc. New Jersey,

USA.

Yamamoto, T., Sashinami, H., Takaya, A., Tomoyasu, T., Matsui, H., Kikuchi, Y., Hanawa T., Kamiya S. and Nakane, A., 2001, Infect Immun, 69, 3164–3174.

DOI: https://doi.org/10.20961/jkpk.v1i1.10100

Refbacks

  • There are currently no refbacks.


Bookmark and Share