Isolasi Jamur Tanah dari Muara Sungai di Desa Kilensari Kecamatan Panarukan Serta Skrining Aktivitas Antibakteri Terhadap Pseudomonas aeruginosa

Amrina Rosyada Fajriyanti, Bawon Triatmoko, Ari Satia Nugraha

Abstract

Kasus infeksi oleh bakteri menjadi sepuluh besar kasus yang mengakibatkan kematian di Indonesia dengan persentase 9,5 %. Penggunaan antibiotik yang tidak tepat untuk mengatasi masalah infeksi dapat menyebabkan resistensi antibakteri. Untuk mengatasi hal tersebut, banyak dilakukan pengembangan terhadap agen-agen antibakteri. Banyak penelitian menunjukkan bahwa aktivitas antibakteri dapat ditemukan pada mikroorganisme dalam tanah. Penelitian ini dilakukan penelusuran dan isolasi fungi tanah muara di Desa Kilensari Kecamatan Panarukan serta skrining aktivitas antibakteri terhadap Pseudomonas aeruginosayang bertujuan untuk memperoleh kandidat antibakteri yang potensial.Metode yang digunakan dalam penentuan aktivitas antibakteri pada penelitian ini yaitu metode mikrodilusi berdasarkan protokol Clinical and Laboratory Standards Institute tahun 2015. Hasil yang diperoleh dari tahap isolasi yaitu 6 isolat fungi tanah yang diberi kode IS-PN-A1, IS-PN-A2, IS-PN-T1, IS-PN-T2, IS-PN-B1 dan IS-PN-B2. Isolat yang didapatkan dilakukan skrining awal uji aktivitas antibakteri dengan metode ujikontak langsung dengan bakteri Pseudomonas aeruginosa. Zona bening yang terbentuk menunjukkan aktivitas antibakteri dari isolat. Isolat fungi tanah muara kemudian dilakukan proses fermentasi untuk memproduksi metabolit sekunder. Hasil fermentasi di lakukan proses ekstraksi menggunakan etil asetat yang nantinya ekstrak akan digunakan dalam uji aktivitas antibakteri menggunakan metode mikrodilusi. Hasil uji aktivitas antibakteri menunjukkan bahwa fungi tanah muara sungai Desa Kilensari Kecamatan Panarukan memiliki aktivitas antibakteri terhadap bakteri Pseudomonas aeruginosa. Persen penghambatan fungi tanah muara dengan nama isolat IS-PN-A1 menghasilkan persen penghambatan sebesar 74,8±2,4%; IS-PN-A2 33,2±7,0%; IS-PN-T1 70,2±4,8%; IS-PN-T2 53,1±3,6%; IS-PN-B1 29,7±4,0%; IS-PN-B2 45,8±2,1 %. 

Keywords

Fungi Tanah; Antibakteri; Pseudomonas aeruginosa

Full Text:

PDF

References

Balouiri, M., Sadiki, M., dan Ibnsouda, S. K. (2016). Methods for in vitro evaluating antimicrobial activity : A review. Journal of Pharmaceutical Analysis, 6(2): pp.71–79. 10.1016/j.jpha.2015.11.005

Cazar, M. E., Schmeda-Hirschmann, G., dan Astudillo, L. (2005). Antimicrobial butyrolactone I derivatives from the Ecuadorian soil fungus Aspergillus terreus Thorn. var terreus. World Journal of Microbiology and Biotechnology, 21(6): pp.1067-1075. 10.1007/s11274-004-8150-5

Clinical and laboratory standards Institute (CLSI), (2015), Methods for Dilution Antimicrobial Susceptibility Test for Bacteria that Grow Aerobically, 10 Edition, Wayne : CLSI supplement M07-A10.USA.

Deshmukh, R., Mathew, A., & Purohit, H. J. (2014). Characterization of antibacterial activity of bikaverin from Fusarium sp . HKF15. Journal of Bioscience and Bioengineering, 117(4): pp.443–448. 10.1016/j.jbiosc.2013.09.017

Karwehl, S., dan Stadler, M. (2016). Exploitation of Fungal Biodiversity for Discovery of Novel Antibiotics. Current Topics in Microbiology and Immunology, 398: pp.303-338. 10.1007/82_2016_496.

Kementerian Kesehatan RI. (2018). Data dan Informasi Profil Kesehatan Indonesia. Kementerian Kesehatan RI, Jakarta, Indonesia.

Khandavilli, R., Meena, R., & Bd, S. (2016). Fungal Phylogenetic Diversity in Estuarine Sediments of Gautami. Current Research in Enviomental & Apllied Mycology, 6(4): pp.268–276. 10.5943/cream/6/4/4

Kirkwood, Z. I., Millar, B. C., Downey, D. G., dan Moore, J. E. (2018). Antimicrobial effect of dimethyl sulfoxide and N, N-Dimethylformamide on Mycobacterium abscessus: Implications for antimicrobial susceptibility testing. International journal of mycobacteriology, 7(2): pp.134. 10.4103/ijmy.ijmy

LoBuglio, K. F., & Taylor, J. W. (1995). Phylogeny and PCR identification of the human pathogenic fungus Penicillium marneffei. Journal of clinical microbiology, 33(1), 85-89.

Mahizan, N. A., Yang, S. K., Moo, C. L., Song, A. A. L., Chong, C. M., Chong, C. W., Abushelaibi, A., Lim, S.H.E. dan Lai, K. S. (2019). Terpene derivatives as a potential agent against antimicrobial resistance (AMR) pathogens. Molecules, 24(14): pp.2631. 10.3390/molecules24142631

Maulana, I. A., Triatmoko, B., & Nugraha, A. S. Skrining Fitokimia dan Uji Aktivitas Antibakteri Ekstrak dan Fraksi Tanaman Senggugu (Rotheca serrata (L.) Steane & Mabb.) terhadap Pseudomonas aeruginosa. JPSCR: Journal of Pharmaceutical Science and Clinical Research, 5(1), 01-11.

O'Neill, J. (2016). Tackling drug-resistant infections globally: final report and recommendations. https://amr-review.org/sites/default/files/160518_Final%20paper_with%20cover.pdf. [Accessed 23th June 2021].

Pamungkas, F.B, Triatmoko, B., dan Nugraha, A. S.. 2021. Penelusuran Dan Isolasi Fungi Tanah KabupatenSitubondo Serta Skrining Aktivitas Antibakteri terhadap Pseudomonas aeruginosa. Jurnal Kefarmasian Indonesia, 19(1): pp. 73-79. 10.35814/jifi.v19i1.750

Pepper, I. L., dan Gentry, T. J. (2015). Earth Environments. in Pepper, I.L., Gerba, C.P., dan Gentry, T. J. Environmental Microbiology, 59-88. Amsterdam, Elsevier. 10.1016/B978-0-12-394626-3.00004-1.

Petit, P., Lucas, E. M., Abreu, L. M., Pfenning, L. H., dan Takahashi, J. A. (2009). Novel antimicrobial secondary metabolites from a Penicillium sp. isolated from Brazilian cerrado soil. Electronic Journal of Biotechnology, 12(4): pp.8-9. 10.2225/vol12-issue4-fulltext-9

Ramirez-Ronda, C. H., Holmes, R. K., dan Sanford, J. P. (1975). Effects of divalent cations on binding of aminoglycoside antibiotics to human serum proteins and to bacteria. Antimicrobial Agents and Chemotherapy, 7(3): pp.239–245. 10.1128/aac.7.3.239

Sabdaningsih, A., Radjasa, O. K., Sabdono, A., dan Trianto, A.(2016) Bioprospecting of Fungi Associated with Cladiella sp. as Antibacterial-MDR against Acinetobacter baumannii from Panjang Island Vicinity. IPCB 2016, 123.

Sara Ramírez, R., Arias M., J. D., Bedoya, J. C., Rueda L., E. A., Sánchez, C. Y., & Granada G., S. D. (2015). Metabolitos producidos por microorganismos antagonistas son capaces de inhibir in vitro los principales patógenos del aguacate. Agronomia Colombiana, 33(1): pp.58–63. 10.15446/agron.colomb.v33n1.48241

Savitri, G. R., Triatmoko, B., & Nugraha, A. S. (2020). Skrining Fitokimia dan Uji Aktivitas Antibakteri Ekstrak dan Fraksi Tumbuhan Anyang-Anyang (Elaeocarpus grandiflorus JE Smith.) terhadap Escherichia coli. JPSCR: Journal of Pharmaceutical Science and Clinical Research, 5(1), 22-32.

Sousa, A. M., Machado, I., Nicolau, A., dan Pereira, M. O. (2013). Improvements on colony morphology identification towards bacterial profiling. Journal of microbiological methods, 95(3): pp.327-335. 10.1016/j.mimet.2013.09.020

Srividya, A. R., Saritha, G. S., dan Suresh, B. (2008). Study of the soil isolates for antimicrobial activity. Indian Journal of Pharmaceutical Sciences, 70(6): pp.812–815. 10.4103/0250-474X.49132

Takahashi, J. A., de Castro, M. M., Souza, G. G., Lucas, E. M., Bracarense, A. A., Abreu, L. M., Marriel, I.E., Oliveira, M.S., Floreano, M.B., dan Oliveira, T. S. (2008). Isolation and screening of fungal species isolated from Brazilian cerrado soil for antibacterial activity against Escherichia coli, Staphylococcus aureus, Salmonella typhimurium, Streptococcus pyogenes and Listeria monocytogenes. Journal de Mycologie Médicale, 18(4): pp.198-204. 10.1016/j.mycmed.2008.08.001

Taylor, P., Pepper, I. L., Gerba, C. P., Newby, D. T., dan Rice, C. W. (2009). Soil : A Public Health Threat or Savior ?. Critical Reviews in Environmental Science and Technology, 39(5): pp.416-432. 10.1080/10643380701664748

Thakur, D., Yadav, A., Gogoi, B. K., dan Bora, T. C. (2007). Isolation and screening of Streptomyces in soil of protected forest areas from the states of Assam and Tripura, India, for antimicrobial metabolites. Journal de Mycologie Médicale, 17(4): pp.242-249. 10.1016/j.mycmed.2007.08.001

Watanabe, T. (2010). Pictorial Atlas of Soil and Seed Fungi : Morphologies of Cultured Fungi and Key to Species. New York: CRC Press.

WHO. (2014). Antimicrobial Resistance. https://apps.who.int/iris/bitstream/handle/10665/112642/9789241564748_eng.pdf?sequence=1. [Accessed, 23th June 2021].

Wibowo, M. S., Julianti, E., dan Radzali, M. D. (2017). Isolation and antibacterial activity of soil-derived fungi from Taman Botani Negara, Shah Alam, Malaysia. Acta Pharmaceutical Indonesia, 42(1): pp.18-24.

DOI: https://doi.org/10.20961/jpscr.v6i2.44007

Refbacks

  • There are currently no refbacks.